1950 William Lee, un expatriado estadounidense de unos 50 años en Ciudad de México, pasa sus días casi solo, salvo algunos contactos con otros miembros de la pequeña comunidad estadounidense. Su encuentro con Eugene Allerton, un joven estudiante recién llegado a la ciudad, le muestra, por primera vez, que finalmente podría ser posible establecer una conexión íntima con alguien.
La película combina decorados y vestuarios fieles a la época, técnicas de producción de la vieja escuela (incluidas retroproyecciones y edificios y paisajes en miniatura) y elecciones musicales deliberadamente anacrónicas (por ejemplo canciones de Nirvana). También ofrece una mezcla de imágenes homoeróticas explícitas, surrealismo y ambigüedad.
Queer se inspira en la novela homónima, algo autobiográfica, de Williams S. Burroughs, escrita a mediados de los años 50 como una extensión de su controvertida Junkie, pero que fue más o menos abandonada por su autor después de que fuera censurada por su editor. Esta última fue finalmente publicada en una versión sin expurgar (y retitulada Junky) en 1977, cuando el público era más receptivo a sus descripciones del consumo de drogas y las citas homosexuales. La gente también había tenido dos décadas para aceptar las posturas contraculturales de Burroughs. Doce años después, a instancias de un agente que había cerrado un lucrativo acuerdo con un nuevo editor, Burroughs sacó Queer del cajón donde la había escondido y la publicó, lo que la convirtió literalmente en una historia fuera de su tiempo.
La película parece dislocada tanto en lo estilístico como en lo temporal y lo geográfico. Los toques deliberadamente modernos y los frecuentes mecanismos de distanciamiento casi brechtianos de la adaptación de Guadagnino (incluida una extensa secuencia de la jungla que fue filmada íntegramente en un estudio o iluminada para que pareciera que lo fue) marcan a Queer como el producto de una conciencia contemporánea, de un artista que se expresa con fluidez en Internet y puede dirigir imágenes que se convierten en memes.
Queer no tiene una trama, sino más bien una acumulación de incidentes que finalmente se suman para formar su historia. Es una historia que sucede principalmente internamente: sobre todo a Bill, mientras intenta averiguar si Eugene es gay y, de ser así, si lo ha descubierto y/o lo manifiesta, abiertamente o en privado. Eugene le lanza a Bill lo que parecen miradas de interés inequívocas, a veces acentuadas por una lánguida cámara lenta, solo para pasar por su lado en el bistró local y luego pasar todo su tiempo con una mujer que podría ser o no su novia.
Después la película se convierte en una especie de historia de amor que se vuelve cada vez más destructiva (hacia Eugene) y autodestructiva (hacia Bill, que también es un destructor). Con el tiempo se deshace de cualquier pretensión de moderación o control y se adentra audaz y deliberadamente en el absurdo, mostrando a los hombres perdiéndose el uno en el otro y en las drogas, y perdiendo la cabeza. Visualmente inventivo, sorprendentemente bien actuado, el resultado es provocativo y sugestivo a la vez.